Si gestionas un eCommerce, ya sabes que facturar no es “emitir un PDF”. En una tienda online conviven: pedidos, pagos, envíos, devoluciones, cupones, reembolsos parciales, marketplaces, ventas B2B/B2C… y, además, integraciones con herramientas externas (logística, CRM, pasarelas de pago, ERP, etc.).

Con la llegada del Reglamento de Sistemas Informáticos de Facturación (SIF) y VERI*FACTU, el listón sube: lo importante no es solo generar facturas, sino garantizar integridad, trazabilidad y control del proceso de facturación desde el software. La Agencia Tributaria lo deja muy claro: existen dos modalidades para cumplir (VERI*FACTU y “no verificable”), y la diferencia clave es si el sistema remite en línea los registros de facturación a la AEAT o si los conserva cumpliendo requisitos reforzados de seguridad y trazabilidad.

En esta guía, enfocada a PrestaShop y Shopify, te explico qué cambia para un eCommerce, cuáles son los plazos oficiales actualizados y cómo montar un flujo de facturación robusto (con Prana como base de control).

Plazos oficiales: ¿cuándo hay que estar adaptado?

La AEAT publicó una nota informativa con los nuevos plazos de adaptación tras la modificación introducida por el Real Decreto-ley 15/2025. En ella se indica:

  • Antes del 1 de enero de 2027: entidades que presenten Impuesto sobre Sociedades.
  • Antes del 1 de julio de 2027: el resto de obligados tributarios.

Para un eCommerce, esto significa algo muy práctico: no esperes a “la fecha límite”. La adaptación no es solo “activar un check”; implica revisar cómo facturas, cómo registras devoluciones, cómo manejas series, cómo integras tu tienda con el sistema que emite la factura y cómo conservas (o remites) los registros.

Qué es VeriFactu (en lenguaje ecommerce): no es un “plugin”, es un sistema de evidencias

La AEAT contempla dos modalidades de Sistemas Informáticos de Facturación:

  • SIF VERI*FACTU: remite en línea, de forma continuada y segura, los registros de facturación a la AEAT.
  • SIF no verificable: no remite, pero debe garantizar integridad, conservación, trazabilidad e inalterabilidad de los registros, y añade obligaciones técnicas adicionales (registro de eventos, firma de registros, exportación, comprobaciones…).

Para una tienda online, el mensaje es: tu eCommerce (PrestaShop/Shopify) no debería “inventarse” la factura final si no es el sistema preparado para ello. Lo habitual (y lo más seguro) es que la tienda gestione el pedido, y el SIF/ERP se encargue de emitir la factura y de mantener la trazabilidad exigida.

El QR y la frase VERI*FACTU: lo verás en tus facturas (sí o sí)

Aquí hay un punto que impacta directamente en eCommerce:

  • La AEAT indica que todas las facturas producidas con un SIF, sea cual sea la modalidad, deberán llevar obligatoriamente el código QR.
  • Las expresiones “VERI*FACTU” o “Factura verificable…” solo serán obligatorias en las facturas impresas emitidas por quienes opten por la modalidad VERI*FACTU.
  • El QR tiene una finalidad clara: permitir al receptor cotejar si la factura está registrada en AEAT (si es VERI*FACTU) o dejar constancia de su existencia (si no es verificable).
  • No se añade a albaranes: el QR tributario solo va en facturas (completas o simplificadas).
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Traducción a eCommerce: si hoy envías la factura en PDF por email o la descargas desde el área de cliente, tu sistema debe ser capaz de generar esa factura con el QR visible (o, en factura estructurada, con el contenido equivalente del QR y la URL de cotejo).

¿A quién afecta en eCommerce? Ojo con SII, B2C y tickets

La AEAT aclara que estos requisitos (QR y, en su caso, la frase VERI*FACTU) son obligatorios para empresarios/profesionales no sujetos al SII cuando deban expedir facturas.

Esto es importante si tu tienda opera con casuísticas mixtas (por ejemplo, una empresa que por volumen o configuración esté en SII, o que tenga parte del negocio en SII y otra no). En eCommerce no conviene “suponer”: conviene mapear tu situación fiscal con asesoría, porque de ahí se deriva el alcance exacto.

El “punto crítico” en PrestaShop y Shopify: ¿cuándo nace la factura?

En tienda online hay tres momentos típicos:

  1. Al confirmar el pago (pedido pagado).
  2. Al enviar (cuando ya está servido, típico si hay backorders).
  3. Al solicitar factura (frecuente en B2C: no todos piden factura formal).

Con VeriFactu, elegir el momento no es solo una decisión operativa: afecta a devoluciones, rectificativas, numeración y trazabilidad.

Recomendación general para eCommerce:

  • Define un evento único y auditable para “emitir factura”: por ejemplo, “pedido pagado y confirmado” o “pedido enviado”.
  • Evita emitir “facturas proforma” como definitivas.
  • Documenta la regla y aplícala igual en todos los canales.

Devoluciones y reembolsos: el punto donde fallan muchas integraciones

En eCommerce, las devoluciones no son una excepción: son parte del día a día.

  • Reembolso total: fácil si tu sistema emite la rectificación correspondiente.
  • Reembolso parcial: aquí suelen aparecer errores (IVA, prorrateos, gastos de envío, cupones).
  • Devolución tras cierre de trimestre: necesitas que el sistema mantenga coherencia histórica y trazabilidad.

Con un SIF bien montado, el flujo de rectificación tiene que estar pensado para que no dependa de “toques manuales” o de editar registros “a posteriori”. Si tu tienda y tu sistema de facturación no están sincronizados en devoluciones, el problema no es VeriFactu: es el flujo.

Qué cambia “de verdad” para un eCommerce: checklist técnico-operativo

A) Una fuente de verdad para facturas

El eCommerce debe ser excelente gestionando pedidos. Pero la factura fiscal (con QR, numeración, registros) debería salir de un sistema de facturación/ERP preparado para ello.

B) Series de facturación por canal (si lo necesitas)

Si vendes por:

  • PrestaShop
  • Shopify
  • Marketplaces (Amazon, Miravia, etc.)
  • TPV físico

…plantea series separadas o reglas claras para evitar duplicidades y facilitar auditoría interna.

C) Datos fiscales bien capturados

En B2B es crítico:

  • NIF/VAT
  • razón social
  • dirección fiscal
  • país (IVA intracomunitario, OSS/IOSS si aplica)

Si esos datos no están bien desde el checkout, el “problema de facturación” aparece tarde y siempre en el peor momento (cierres, campañas, inspecciones, etc.).

D) Trazabilidad de integraciones

Conectores, automatizaciones, apps… Todo suma. Si hoy tu tienda genera facturas en un módulo y mañana cambias de módulo, la trazabilidad se rompe. Con VeriFactu, lo que interesa es que la emisión y registro vivan en el sistema que va a sostener el cumplimiento.

Cómo encaja Prana en este escenario (PrestaShop + Shopify)

Prana se posiciona como software de facturación y contabilidad orientado a centralizar facturación, impuestos, tesorería y clientes. Y para eCommerce, la clave es la centralización: que tu tienda no sea una isla y que tus ventas acaben aterrizando con orden en un único sistema.

PrestaShop + Prana

Prana dispone de un Conector ERP PrestaShop para sincronizar ventas, productos y datos sin teclear manualmente, lo que encaja con el objetivo de reducir errores y mantener consistencia.

Qué aporta en clave VeriFactu (en términos operativos):

  • Menos “copiar/pegar” (menos fallos humanos).
  • Ventas centralizadas para generar facturación y registros con coherencia.
  • Mejor preparación para el QR y para un modelo de trazabilidad consistente.
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Shopify + Prana

En Shopify, el enfoque recomendado es el mismo: que Shopify gestione el pedido y que el sistema central (Prana) gestione la facturación y control. Aunque tu integración concreta dependerá del stack (apps, middleware, API), Prana destaca que tiene una API bien documentada para integrar soluciones de terceros.

Traducción: si hoy tu Shopify está conectada a varias herramientas, unificar la “verdad” fiscal en un sistema central reduce fricción y te ayuda a llegar a 2027 con menos improvisación.

Plan de adaptación paso a paso para un eCommerce (sin parar la tienda)

Paso 1: Inventario de canales y puntos de emisión

Lista:

  • Dónde vendes (PrestaShop/Shopify/marketplaces/TPV)
  • Dónde se “crea” la factura hoy
  • Qué documentos envías al cliente (PDF, factura estructurada, etc.)

Paso 2: Define tu “evento factura”

Elige el momento único de emisión (pago, envío…) y alinéalo con devoluciones.

Paso 3: Centraliza en un SIF/ERP

Evita “facturar en cada canal”. Lo sostenible es un punto central (Prana) y canales que alimentan datos.

Paso 4: Asegura QR y trazabilidad documental

Recuerda: el QR es obligatorio en facturas producidas con SIF, independientemente de la modalidad.

Paso 5: Prueba con escenarios reales

Antes de ponerlo en producción al 100%:

  • reembolso parcial
  • pedido con cupón
  • gasto de envío con IVA distinto
  • pedido B2B con NIF intracomunitario
  • factura rectificativa

Errores típicos en eCommerce (y cómo evitarlos)

  • Facturas duplicadas por emitir en tienda y en ERP a la vez.
  • Numeración rota por cambios de módulo o por “ediciones” manuales.
  • Devoluciones mal tratadas (parciales, con cupones).
  • Datos fiscales incompletos en checkout, que obligan a rehacer facturas.
  • Demasiadas herramientas sin un centro: cada app hace una parte, nadie sostiene el todo.

Con VeriFactu, estos errores no solo “molestan”: te pueden complicar el cumplimiento, porque lo que pide la AEAT es coherencia del sistema y trazabilidad del proceso.

¿Vendes en PrestaShop o Shopify y quieres llegar a 2027 con la facturación bajo control (sin parches ni prisas)? Centraliza tus ventas, clientes e impuestos en un único sistema y prepara tu eCommerce para VeriFactu con un flujo sólido. Empieza con Prana y conecta tu tienda para automatizar y ganar trazabilidad desde hoy.