Si gestionas un eCommerce, ya sabes que facturar no es “emitir un PDF”. En una tienda online conviven: pedidos, pagos, envíos, devoluciones, cupones, reembolsos parciales, marketplaces, ventas B2B/B2C… y, además, integraciones con herramientas externas (logística, CRM, pasarelas de pago, ERP, etc.).
Con la llegada del Reglamento de Sistemas Informáticos de Facturación (SIF) y VERI*FACTU, el listón sube: lo importante no es solo generar facturas, sino garantizar integridad, trazabilidad y control del proceso de facturación desde el software. La Agencia Tributaria lo deja muy claro: existen dos modalidades para cumplir (VERI*FACTU y “no verificable”), y la diferencia clave es si el sistema remite en línea los registros de facturación a la AEAT o si los conserva cumpliendo requisitos reforzados de seguridad y trazabilidad.
En esta guía, enfocada a PrestaShop y Shopify, te explico qué cambia para un eCommerce, cuáles son los plazos oficiales actualizados y cómo montar un flujo de facturación robusto (con Prana como base de control).
Plazos oficiales: ¿cuándo hay que estar adaptado?
La AEAT publicó una nota informativa con los nuevos plazos de adaptación tras la modificación introducida por el Real Decreto-ley 15/2025. En ella se indica:
- Antes del 1 de enero de 2027: entidades que presenten Impuesto sobre Sociedades.
- Antes del 1 de julio de 2027: el resto de obligados tributarios.
Para un eCommerce, esto significa algo muy práctico: no esperes a “la fecha límite”. La adaptación no es solo “activar un check”; implica revisar cómo facturas, cómo registras devoluciones, cómo manejas series, cómo integras tu tienda con el sistema que emite la factura y cómo conservas (o remites) los registros.
Qué es VeriFactu (en lenguaje ecommerce): no es un “plugin”, es un sistema de evidencias
La AEAT contempla dos modalidades de Sistemas Informáticos de Facturación:
- SIF VERI*FACTU: remite en línea, de forma continuada y segura, los registros de facturación a la AEAT.
- SIF no verificable: no remite, pero debe garantizar integridad, conservación, trazabilidad e inalterabilidad de los registros, y añade obligaciones técnicas adicionales (registro de eventos, firma de registros, exportación, comprobaciones…).
Para una tienda online, el mensaje es: tu eCommerce (PrestaShop/Shopify) no debería “inventarse” la factura final si no es el sistema preparado para ello. Lo habitual (y lo más seguro) es que la tienda gestione el pedido, y el SIF/ERP se encargue de emitir la factura y de mantener la trazabilidad exigida.
El QR y la frase VERI*FACTU: lo verás en tus facturas (sí o sí)
Aquí hay un punto que impacta directamente en eCommerce:
- La AEAT indica que todas las facturas producidas con un SIF, sea cual sea la modalidad, deberán llevar obligatoriamente el código QR.
- Las expresiones “VERI*FACTU” o “Factura verificable…” solo serán obligatorias en las facturas impresas emitidas por quienes opten por la modalidad VERI*FACTU.
- El QR tiene una finalidad clara: permitir al receptor cotejar si la factura está registrada en AEAT (si es VERI*FACTU) o dejar constancia de su existencia (si no es verificable).
- No se añade a albaranes: el QR tributario solo va en facturas (completas o simplificadas).

Traducción a eCommerce: si hoy envías la factura en PDF por email o la descargas desde el área de cliente, tu sistema debe ser capaz de generar esa factura con el QR visible (o, en factura estructurada, con el contenido equivalente del QR y la URL de cotejo).
¿A quién afecta en eCommerce? Ojo con SII, B2C y tickets
La AEAT aclara que estos requisitos (QR y, en su caso, la frase VERI*FACTU) son obligatorios para empresarios/profesionales no sujetos al SII cuando deban expedir facturas.
Esto es importante si tu tienda opera con casuísticas mixtas (por ejemplo, una empresa que por volumen o configuración esté en SII, o que tenga parte del negocio en SII y otra no). En eCommerce no conviene “suponer”: conviene mapear tu situación fiscal con asesoría, porque de ahí se deriva el alcance exacto.
El “punto crítico” en PrestaShop y Shopify: ¿cuándo nace la factura?
En tienda online hay tres momentos típicos:
- Al confirmar el pago (pedido pagado).
- Al enviar (cuando ya está servido, típico si hay backorders).
- Al solicitar factura (frecuente en B2C: no todos piden factura formal).
Con VeriFactu, elegir el momento no es solo una decisión operativa: afecta a devoluciones, rectificativas, numeración y trazabilidad.
Recomendación general para eCommerce:
- Define un evento único y auditable para “emitir factura”: por ejemplo, “pedido pagado y confirmado” o “pedido enviado”.
- Evita emitir “facturas proforma” como definitivas.
- Documenta la regla y aplícala igual en todos los canales.
Devoluciones y reembolsos: el punto donde fallan muchas integraciones
En eCommerce, las devoluciones no son una excepción: son parte del día a día.
- Reembolso total: fácil si tu sistema emite la rectificación correspondiente.
- Reembolso parcial: aquí suelen aparecer errores (IVA, prorrateos, gastos de envío, cupones).
- Devolución tras cierre de trimestre: necesitas que el sistema mantenga coherencia histórica y trazabilidad.
Con un SIF bien montado, el flujo de rectificación tiene que estar pensado para que no dependa de “toques manuales” o de editar registros “a posteriori”. Si tu tienda y tu sistema de facturación no están sincronizados en devoluciones, el problema no es VeriFactu: es el flujo.
Qué cambia “de verdad” para un eCommerce: checklist técnico-operativo
A) Una fuente de verdad para facturas
El eCommerce debe ser excelente gestionando pedidos. Pero la factura fiscal (con QR, numeración, registros) debería salir de un sistema de facturación/ERP preparado para ello.
B) Series de facturación por canal (si lo necesitas)
Si vendes por:
- PrestaShop
- Shopify
- Marketplaces (Amazon, Miravia, etc.)
- TPV físico
…plantea series separadas o reglas claras para evitar duplicidades y facilitar auditoría interna.
C) Datos fiscales bien capturados
En B2B es crítico:
- NIF/VAT
- razón social
- dirección fiscal
- país (IVA intracomunitario, OSS/IOSS si aplica)
Si esos datos no están bien desde el checkout, el “problema de facturación” aparece tarde y siempre en el peor momento (cierres, campañas, inspecciones, etc.).
D) Trazabilidad de integraciones
Conectores, automatizaciones, apps… Todo suma. Si hoy tu tienda genera facturas en un módulo y mañana cambias de módulo, la trazabilidad se rompe. Con VeriFactu, lo que interesa es que la emisión y registro vivan en el sistema que va a sostener el cumplimiento.
Cómo encaja Prana en este escenario (PrestaShop + Shopify)
Prana se posiciona como software de facturación y contabilidad orientado a centralizar facturación, impuestos, tesorería y clientes. Y para eCommerce, la clave es la centralización: que tu tienda no sea una isla y que tus ventas acaben aterrizando con orden en un único sistema.
PrestaShop + Prana
Prana dispone de un Conector ERP PrestaShop para sincronizar ventas, productos y datos sin teclear manualmente, lo que encaja con el objetivo de reducir errores y mantener consistencia.
Qué aporta en clave VeriFactu (en términos operativos):
- Menos “copiar/pegar” (menos fallos humanos).
- Ventas centralizadas para generar facturación y registros con coherencia.
- Mejor preparación para el QR y para un modelo de trazabilidad consistente.

Shopify + Prana
En Shopify, el enfoque recomendado es el mismo: que Shopify gestione el pedido y que el sistema central (Prana) gestione la facturación y control. Aunque tu integración concreta dependerá del stack (apps, middleware, API), Prana destaca que tiene una API bien documentada para integrar soluciones de terceros.
Traducción: si hoy tu Shopify está conectada a varias herramientas, unificar la “verdad” fiscal en un sistema central reduce fricción y te ayuda a llegar a 2027 con menos improvisación.
Plan de adaptación paso a paso para un eCommerce (sin parar la tienda)
Paso 1: Inventario de canales y puntos de emisión
Lista:
- Dónde vendes (PrestaShop/Shopify/marketplaces/TPV)
- Dónde se “crea” la factura hoy
- Qué documentos envías al cliente (PDF, factura estructurada, etc.)
Paso 2: Define tu “evento factura”
Elige el momento único de emisión (pago, envío…) y alinéalo con devoluciones.
Paso 3: Centraliza en un SIF/ERP
Evita “facturar en cada canal”. Lo sostenible es un punto central (Prana) y canales que alimentan datos.
Paso 4: Asegura QR y trazabilidad documental
Recuerda: el QR es obligatorio en facturas producidas con SIF, independientemente de la modalidad.
Paso 5: Prueba con escenarios reales
Antes de ponerlo en producción al 100%:
- reembolso parcial
- pedido con cupón
- gasto de envío con IVA distinto
- pedido B2B con NIF intracomunitario
- factura rectificativa
Errores típicos en eCommerce (y cómo evitarlos)
- Facturas duplicadas por emitir en tienda y en ERP a la vez.
- Numeración rota por cambios de módulo o por “ediciones” manuales.
- Devoluciones mal tratadas (parciales, con cupones).
- Datos fiscales incompletos en checkout, que obligan a rehacer facturas.
- Demasiadas herramientas sin un centro: cada app hace una parte, nadie sostiene el todo.
Con VeriFactu, estos errores no solo “molestan”: te pueden complicar el cumplimiento, porque lo que pide la AEAT es coherencia del sistema y trazabilidad del proceso.
¿Vendes en PrestaShop o Shopify y quieres llegar a 2027 con la facturación bajo control (sin parches ni prisas)? Centraliza tus ventas, clientes e impuestos en un único sistema y prepara tu eCommerce para VeriFactu con un flujo sólido. Empieza con Prana y conecta tu tienda para automatizar y ganar trazabilidad desde hoy.

